Skillnad mellan endonukleas och exonukleas | Endonukleas vs Exonukleas

Huvudskillnad - Endonukleas vs exonukleas

Innan man tittar på skillnaden mellan endonukleas och exonukleas är det viktigt att veta vad exakt nukleas är. Ett nukleas är ett enzym med förmåga att klyva fosfodiesterbindningar mellan nukleotider i nukleinsyror. Endonukleas och exonukleas är två klassificeringar av nukleaser. Den viktigaste skillnaden mellan endonukleas och exonukleas är att endonukleaser klyver bindningarna mellan nukleotidsyramolekylen medan exonukleaser spaltar bindningen mellan nukleotider vid 3'- eller 5'-ändarna av nukleinsyramolekylen.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelfaktor

2. Vad är en nukleas

3. Vad är ett endonukleas

4. Vad är ett exonukleas

5. Side vid sida-jämförelse - Endonukleas vs Exonukleas

6. Sammanfattning

Vad är ett nukleas?

Ett nukleas är ett enzym som har förmågan att klyva fosfodiesterbindningar mellan nukleotider i nukleinsyror. Det tillhör hydrolasenzymgruppen eftersom det hydrolyserar de kemiska bindningarna mellan nukleotider. Detta enzym är väsentligt för naturliga DNA-reparationsmekanismer som förekommer i cellerna och i biotekniska processer som genkloning, rekombinant DNA-teknik, RFLP, AFLP, gensekvensering, genterapi, genomkartläggning etc.

Det finns två huvudtyper av nukleaser: ribonukleas och deoxiribonukleas, som agerar och bryter de kemiska bindningarna mellan monomerer av RNA respektive DNA. Enligt nukleasernas verkningsställe kategoriseras de ytterligare i två grupper, nämligen endonukleas och exonukleas. Endonukleaser känner igen specifika sekvensområden av nukleinsyrorna och klyver fosfodiesterbindningarna mellan nukleotider som är belägna i mitten av nukleinsyrorna. Exonukleaser klyver fosfodiesterbindningar mellan nukleotider som är belägna vid ändarna av nukleinsyrorna.

Figur 1: Nukleasaktivitet

Vad är ett endonukleas?

Endonukleas är en typ av nukleaser som klyver nukleinsyror från mitten. Det känner igen specifika nukleotidsekvenser av nukleinsyra och bryter de kemiska bindningarna mellan nukleotider. De är också kända som restriktionsendonukleaser eftersom de söker specifika restriktionsställen och klyver bindningen och producerar restriktionsfragment. Mer än 100 restriktionsendonukleaser identifieras i bakterier och archaea och erhålls för kommersiella ändamål.

Restriktionsendonukleaser används i stor utsträckning inom bioteknik. De spelar en viktig roll i molekylär kloning. De flesta av dem är dimeriska enzymer som består av två proteinunderenheter. Två proteinunderenheter sätter in det dubbelsträngade DNA och klämer separat båda strängarna från båda sidor. Det finns hundratals typer av restriktionsendonukleaser med unika igenkänningsställen i bakterier. På grund av deras höga specificitet i begränsning klarar de endast vid specifika sekvenser. Därför betraktas de som mycket användbara molekylära verktyg i rekombinant DNA-teknik. Utan restriktionsendonukleaser är inte produktion av rekombinant DNA-molekyl möjlig. Skapandet av den rekombinanta DNA-molekylen är det grundläggande steget i mest molekylära biologiska teknologier.

För att förstå den unika sekvensigenkänningen genom restriktionsendonukleaser, kommer följande exempel att hjälpa läsarna.

Bam HI är ett restriktionsendonukleas som söker efter följande restriktionsplats i DNA-molekylen (platsen visas med röda bokstäver).

När Bam HI klyvlar nukleinsyran från restriktionsstället producerar den följande två fragment.

EcoRI är ett annat restriktionsendonukleas, som är mycket användbart i rekombinant DNA-teknik, verkar på dess specifika restriktionsigenkänningssätt och klyver DNA såsom visas i figur 2.

Figur 2: EcoRI

Vad är ett exonukleas?

Exonukleas är ett nukleasenzym som klyver kemiska bindningar mellan nukleotider vid 3'- eller 5'-ändarna av nukleinsyrakedjorna. Det bryter med nukleotider i slutet av kedjan och producerar nukleosider genom att överföra fosfatgrupper till vatten. Exonukleaser finns i arkeor, bakterier och eukaryoter. I E coli finns 17 olika exonukleaser närvarande inklusive DNA-polymeras 1, 2 och 3. Flera DNA-polymeraser uppvisar 3 'till 5' exonukleas-korrekturläsningsaktivitet.

Exonukleaser är viktiga vid DNA-reparation, genetisk rekombination, förebyggande av förekomsten av mutationer, genomstabilisering etc.

Figur 3: Exonukleasverkan av RecBCD av E Coli

Vad är skillnaden mellan endonukleas och exonukleas?

- diff Artikel Middle before Table ->

Endonukleas vs Exonuclease
Endonukleas är en typ av nukleasenzymer som klyver bindningarna mellan nukleotiderna i nukleinsyramolekylen.	Exonukleas är en typ av nukleasenzymer som klyver bindningen mellan nukleotider vid 3'- eller 5'-ändarna av nukleinsyramolekylen.
End-Produkter
Endonukleaser producerar oligonukleotidrestriktionsfragment	Exonukleotider producerar nukleosider
Funktion
De bryter fosfodiesterbindningar och producerar restriktionsfragment. Men de punkter tar bort nukleotider en efter en.	De tar bort nukleotiderna en efter en från nukleinsyrernas ändar.
Exempel
Exempel är BamHI, EcoRI, Hind III, Hpa I, Sma I,	Exempel innefattar exonukleas I, exonukleas III, RecBCD (exonukleas V), RecJ exonukleas, exonukleas VIII / RecE, exonukleas IX, Exonukleas T, exonukleas X etc.

Sammanfattning - Endonukleas vs Exonukleas

Nukleaser är ansvariga för att bryta fosfodiester kemiska bindningar mellan nukleinsyror nukleotider. Nukleaser kan verka inom eller vid ändarna av nukleinsyrakedjan. Enligt handlingsplatsen finns två huvudtyper av nukleaser i organismer. De är endonukleas och exonukleas. Endonukleaser klyver nukleotider från mitten av kedjan medan exonukleaser spaltar nukleotider från ändarna av nukleinsyrakedjan. Endonukleaser är mycket viktiga vid rekombinant DNA-teknik eftersom de känner igen specifika bassekvenser i nukleinsyrakedjan och bryter bindningar mellan nukleotider.

Referens:

2. Pingoud, Alfred och Albert Jeltsch. "Struktur och funktion av typ II restriktionsendonukleaser. "Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 15 september 2001. Web. 11 mars 2017

3. Lovett, Susan T. "DNA exonukleaser av Escherichia coli. "EcoSal Plus. U. S. National Library of Medicine, dec. 2011. Web. 11 mars 2017

Image Courtesy:

1. "Restriktionsenzym Eco RI" Av Tinastella - Egent arbete (Public Domain) via Commons Wikimedia

2. "HR RecBCD RecA" Av Emw2012 - Egent arbete (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia