Skillnad mellan Selectable Marker och Reporter Gene | Selectable Marker vs Reporter Gene

Huvudskillnad - Valbar markör vs Reportergen

Genetekniksteknik används för att överföra viktiga gener från organism till annan organism. Infogning av en främmande gen i en annan organisms genom och att den uttrycks i värdcellen är svåraste steg vid genöverföring. För att detektera transformationsprocessens framgång används en selekterbar markör och en reportergen i den rekombinanta molekylen. En selekterbar markör är en DNA-sekvens eller en gen som uttrycker och selekterar de transformerade cellerna från de icke-transformerade cellerna. En reportergen är en annan gen som används för att skilja transformerade celler och att kvantifiera eller detektera hur den insatta genen fungerar inom värden. Den viktigaste skillnaden mellan selekterbar markör och reportergen är att den selekterbara markören används för att avskärma de icke-transformerade cellerna och att signalera de transformerade cellerna medan reportergen används för att kvantifiera nivån av genuttryck inom värden.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelfaktor

2. Vad är Selectable Marker

3. Vad är Reporter Gene

4. Jämförelse vid sida vid sida - Valbar markör vs Reportergen

5. Sammanfattning

Vad är en markeringsmarkör?

I genteknik införs genen av intresse i en lämplig vektor och transformeras till värdorganismer. Omvandlingen lyckas emellertid bara i de behöriga värdcellerna, och det finns en möjlighet att värdceller avvisar upptaget av främmande DNA. Därför är differentiering av de transformerade och icke-transformerade cellerna viktiga för att fortsätta med ytterligare experiment. Forskare införlivar därför en selekterbar markörgen till vektor för enkelt val av de transformerade cellerna från icke-transformerade celler. En selekterbar markör är en DNA-sekvens, speciellt en gen som är användbar vid identifiering av de transformerade cellerna. Denna markörgen uppvisar ett drag som passar ett artificiellt urval av transformerade celler från icke-transformerade celler på ett medium.

Vanliga valbara markörer som används i molekylärbiologi är antibiotikaresistenta gener. En antibiotikaresistensgen införs i vektorn och transformeras till värdceller speciellt för värdbakterien. Det specifika antibiotikumet införlivas i bakteriens odlingsmedium. På grund av närvaron av den selektiva markören kan de celler som innehåller den lämpliga selekterbara markören under de selektiva betingelserna överleva.Icke-transformerade celler kan inte växa i det antibiotikuminnehållande mediet. På grund av den selekterbara markören som är resistent mot antibiotika identifieras därför transformerade celler lätt.

Gen som ger egenskaper för antimetaboliter, herbicider används som selektiva markörer i kloningsvektorer inom växtgenetisk teknik. Denna cotransformation av selektiva markörer i genetiskt modifierade organismer har emellertid negativa effekter på miljön och människan. Utsläppen av antibiotikaresistenta bakterier kan öka antibiotikaresistiviteten hos mänskliga patogener. Det kan kontaminera produkten eller biomassan med antibiotika och kan förlora det selektiva trycket som ett resultat av antibioticsnedbrytning och inaktivering.

Figur 01: Plasmidvektor för genöverföring med selekterbar markör

Vad är ett Reportergen?

Reportergener är gener som möjliggör detektering eller mätning av det insatta genuttrycket. Dessa reportergener kan bindas till regulatoriska sekvenser av genen av intresse för att signalera uttrycksplatsen eller nivåerna. Under transkriptionen av gener under samma promotor transkriberas därför till en enda mRNA-sekvens och transleras därefter till ett protein som kan indikera nivån av genuttryck.

Reportergener är av olika slag, och de innehåller visuellt identifierbara egenskaper som vanligtvis är involverade i fluorescerande och luminescerande proteiner. Gener som kodar fluorescerande protein och enzymer omvandlar osynliga substrat till luminescerande eller färgade produkter genom att signalera det framgångsrika genuttrycket och ge möjlighet till kvantifiering av genuttrycket.

Figur 02: Reportergenuttryck

Vad är skillnaden mellan selekterbar markör och reportergen?

- diff Artikeln före tabell ->

Valbar markör vs Reportergen
Valbar markör är en slags DNA-sekvens som hjälper till att skilja transformerade celler med icke transformerade celler.	Reportergen är en gen som hjälper till att kvantifiera uttrycket av den önskade genen som är införd i värdcellen.
Produktionens egenskaper
Generen kodas med egenskaper som hjälper till konstgjort urval på växande medier.	Gener är kodade med visuellt identifierbara egenskaper.
Användning
Antibiotikaresistensgener, antimetabolitgener, herbicidresistensgener etc. är exempel på selekterbar markör.	Generalkod för grönt fluorescerande protein, p-glukuronidas, kloramfenikolacetyltransferas, rött fluorescerande protein etc. är exempel.

Sammanfattning - Selectable Marker vs Reporter Gene

Valbara markörer låter transformerade celler växa i selektivt medium doserat med speciellt antibiotikum eller herbicid. De används för tidigt urval av transformerade celler. Reportergener används för att kvantifiera uttrycksnivån för den önskade genen insatt. De tillåter också differentiering av transformerade och icke-transformerade celler. Detta är skillnaden mellan selekterbar markör och reportergen.Både selekterbar markör och reportergen anses vara viktiga markörer inom genteknik.

Referenser:

1. Ziemienowicz, Alicja. "Växtvalbara markörer och reportergener. ”Springer. Springer-Verlag, n. d. Webb. 23 mars 2017.

2. Shih, Chen-Han, Hsiao-Yin Chen, Hung-Chieh Lee och Huai-Jen Tsai. "Lila kromoproteingen tjänar som en ny markör för transgenes av Microalga Nannochloropsis oculata. "PLOS ONE. Public Library of Science, n. d. Webb. 25 mars 2017

Image Courtesy:

1. "Plasmid med insättning" Av Michael Jeltsch - Egent arbete (CC BY-SA 4. 0) via Commons Wikimedia

2. "Reportergen" Av TransControl på en. wikipedia (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia