Skillnad mellan Metabolomics och Metabonomics | Metabolomics vs Metabonomics

Key Difference - Metabolomics vs Metabonomics

Metaboliter är de små molekylerna som är involverade i metaboliska reaktioner i cellerna. Metaboliter innefattar metaboliska mellanprodukter, hormoner, sekundära metaboliter, signalmolekyler etc. De är de fungerande molekylerna av biokemiska reaktioner hos cellerna. En komplett uppsättning metaboliter av ett biologiskt prov eller en enda organism är känd som metabolom. Metabolom är en dynamisk samling som förändras varje sekund i kroppen. Metabolomics och metabonomics är två termer relaterade till studien av metabolom av en organism. Den viktigaste skillnaden mellan metabolomik och metabonomi är att metabolomik är mer oroad över normal endogen metabolism och metabolisk profilering på cellulär eller organnivå medan metabonomi är mer oroad över att utöka metabolisk profilering med informationen metaboliska störningar på grund av miljöfaktorer, sjukdomar, tarmmikroorganismer och jämförelse av metabolisk profilering etc. Metabolomik drivs huvudsakligen av masspektrometri och metabonomi använder NMR-spektroskopi för metabolitanalys.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelfaktor

2. Vad är Metabolomics

3. Vad är Metabonomics

4. Jämförelse vid sida vid sida - Metabolomics vs Metabonomics

5. Sammanfattning

Vad är Metabolomics?

Metabolomics är studien av metaboliska processer som förekommer i celler, biofluider, vävnader eller organismer. Det innefattar identifiering och kvantifiering av cellulära metaboliter med goda analytiska och statistiska verktyg. Metabolomics anses vara en viktig studie eftersom det avslöjar information om ämnesomsättningen hos en organism.

För att studera substrat och produkter av metaboliska reaktioner använder metabolomics masspektrometri som en analytisk plattform. Masspektrometri avslöjar typer av metaboliter och deras koncentrationer, vilket återspeglar cellens faktiska biokemiska tillstånd eller vävnaderna. Följaktligen kan metabolomik anses vara den bästa representanten för molekylär fenotyp av en organism. Metabolomics är en omic-teknik av små molekyler av organismerna och jämfört med andra omiska studier; metabolomics är mycket viktigt eftersom den direkt återspeglar den aktuella statusen för cellens biokemiska reaktion.

Metabolomics kan också betraktas som en förlängning av proteomik eftersom de genereras på grund av verksamheten hos enzymer som är proteiner som visas i följande figur.

Figur 01: Metabolomics-schema

Vad är Metabonomics?

Metabonomi definieras som en kvantitativ mätning av multiparametriska metaboliska reaktioner vid specifika tider i relation till patofysiologiska stress eller genetisk modifiering. Detta brukar tillämpas på studier som utförs om mänsklig näring och svar på droger eller sjukdomar. Detta tillvägagångssätt var banbrytande av Jeremy Nicholson vid Imperial College i London och det har använts inom ett antal områden, inklusive toxikologi, sjukdomsdiagnos, näring etc. Historiskt var metabonomi en av de första metoderna för att tillämpa systembiologiens omfattning för studier av metabolism.

Metabonomi är mer oroad över att man jämför biokemiska profiler istället för att identifiera enskilda metaboliska föreningar i metabolomik. Därför kan metabonomi definieras som en delmängd av metabolomics. Det betonar främst jämförelsen av metaboliska profiler hos olika populationer med avseende på sjukdomar, miljöbelastningar, genetisk modifiering, näring, droger etc. eftersom metaboliter är de goda markörerna som signalerar sjukdomsförhållandena, effekterna av läkemedel, miljöbelastningar, exponering för toxiner, etc.

Metabonomiska studier avslöjar både intracellulära och extracellulära metaboliter. Det använder höga genomströmningstekniker för att analysera ett stort antal metaboliter samtidigt och upprepade gånger, vilket möjliggör tidsmässig undersökning av cellens fysiologiska status. Det avslöjar också korrelationen mellan metaboliter och patologisk status hos organismen. För att stödja metabonomiska studier kan genomics och proteomics användas eftersom de är inbördes relaterade som visas i ovanstående figur.

Vad är skillnaden mellan Metabolomics och Metabonomics?

Metabolomik är studien av den fullständiga uppsättningen metaboliter av en organism.

Metabonomi är den kvantitativa studien av multiparametriska metaboliska reaktioner hos levande system på tidsmässig basis. till patofysiologiska stimuli eller genetisk modifiering.
Huvudsaklig oro	Metabolomiken är mer oroad över metabolisk profilering och identifierar individuella metaboliter som finns i cellerna.
Metabonomi är mer angelägen om att jämföra metaboliter eller metaboliska profiler hos populationer i relation till genetiska modifieringar, sjukdomar, miljöbelastningar, patologiska stimuli, droger etc.
Information	Metabolomik är huvudsakligen inriktad på endogen metabolism.
Metabonomi är inte begränsad till endogen metabolism. Det sträcker sig för att hitta information om störningar av ämnesomsättning som orsakas av interna och externa faktorer som dietmönster, toxiner, sjukdomsprocesser etc.
Analytiska verktyg	Det använder masspektrometri som den främsta analytiska plattformen
Metabonomics använder NMR spektroskopi som den huvudsakliga analytiska plattformen.
Sammanfattning - Metabolomics vs Metabonomics	Metabolom representerar den kompletta uppsättningen små molekyler som kallas metaboliter närvarande i en cell eller i en organism.Metabolomics är studien av hela metabolomen för att skapa den metaboliska profilen. Metabolomics gör det möjligt för forskare att mäta cellens eller organismens faktiska fysiologiska status. Metabonomi är en del av metabolomics som sträcker sig för att extrahera information om de multiparametriska metabolismen av levande system till patofysiologiska stimuli och genetiska modifieringar. Metabonomi handlar inte bara om enskild metabolisk profilering som metabolomics; det jämför metaboliska profiler i förhållande till andra faktorer som miljöbelastningar, sjukdomar, toxiner, etc. Både metabolomics och metabonomics involverar studier av organismernas metaboliter för att mäta cellens faktiska fysiologiska status. Därför betraktas dessa två gånger ibland som synonymer, utan att överväga skillnaden mellan metabolomik och metabonomi.

Referens:

1. Roessner, Ute och Jairus Bowne. "Vad handlar metabolomik om? "BioTechniques - Vad handlar metabolomik om? N. p., April 2009. Web. 24 april 2017

2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomics and Metabonomics. "Springer. Springer London, 01 jan 1970. Web. 25 april 2017

Image Courtesy:

1. "Metabolomics schema" Av LMaps (talk) - Own Work (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia