Skillnad mellan Alpha Helix och Beta Plated Sheet | Alpha Helix och Beta Plated Sheet

Huvudskillnad - Alpha Helix vs Beta Plated Sheet

Alfa-helixer och betongpläterade ark är de två vanligaste sekundära strukturerna i en polypeptidkedja. Dessa två strukturella komponenter är de första huvudstegen i processen att vika en polypeptidkedja. nyckelförskjutningen mellan Alpha Helix och Beta Plated Sheet finns i deras struktur ; De har två olika former för att göra ett visst jobb.

Vad är Alpha Helix?

En alfa-helix är en högerhänt spole av aminosyrarester på en polypeptidkedja. Utbredningen av aminosyrarester kan variera från 4 till 40 rester. Vätgasbindningarna som bildas mellan syret av C = O-gruppen på toppspolen och väte från N-H-gruppen i bottenspolen hjälper till att hålla spolen ihop. En vätebindning bildas per var fjärde aminosyrarester i kedjan på ovanstående sätt. Detta enhetliga mönster ger det bestämda egenskaper som spolens tjocklek och det dikterar längden på varje komplett sväng längs spiralaxeln. Stabiliteten hos alfa-helixstrukturen beror på flera faktorer.

O-atomer i rött, N-atomer i blått och vätebindningar som gröna prickade linjer

Vad är Beta Pläterad Plåt?

Beta-pläterad plåt, även känd som betongblad, betraktas som den andra formen av sekundär struktur i proteiner. Den innehåller betongsträngar som är kopplade i sidled med minst två eller tre ryggradsvättebindningar för att bilda ett vridet, pläterat ark som visas på bilden. En beta-sträng är en sträcka av polypeptidkedjan; dess längd är generellt lika med 3 till 10 aminosyror, inklusive ryggrad i en förlängd bekräftelse.

4-strängat antiparallellt P-fragment från en kristallstruktur av enzymkatalasen.

a) visar de antiparallella vätebindningarna (prickade) mellan peptid-NH- och CO-grupper på intilliggande strängar. Pilar indikerar kedjeriktning, och elektrondensitetskonturerna skisserar icke-H-atomer. O-atomer är röda bollar, N-atomer är blåa och H-atomer utelämnas för enkelhet; sidokedjor visas endast ut till den första sidokedjens C-atom (grön)

b) Fördjupning av de centrala två p-strängarna

I betongpläterade ark löper polypeptidkedjorna parallellt med varandra. Det blir namnet "pläterat ark" på grund av strukturens vågliknande utseende. De är kopplade ihop med vätebindningar.Denna struktur möjliggör bildning av fler vätebindningar genom att sträcka ut polypeptidkedjan.

Vad är skillnaden mellan Alpha Helix och Beta Plated Sheet?

Struktur av Alpha Helix och Beta Pläterad Plåt

Alpha Helix:

I denna struktur är polypeptid-ryggraden tätt bunden runt en imaginär axel som en spiralstruktur. Det är också känt som det helikoidala arrangemanget av peptidkedjan.

Bildandet av alfa-helixstruktur sker när polypeptidkedjorna vrids i en spiral. Detta möjliggör att alla aminosyror i kedjan bildar vätebindningar (en bindning mellan en syremolekyl och en vätemolekyl) med varandra. Vätebindningarna medger att spiralen håller spiralformen och ger en tät spole. Denna spiralform gör alfa-helixen mycket stark.

Vätebindningar indikeras med de gula prickarna.

Beta-pläterad plåt:

När två eller flera fragment av polypeptidkedjorna överlappar varandra, bildar en rad vätebindningar med varandra, kan följande strukturer hittas. Det kan hända på två sätt; parallellarrangemang och parallellarrangemang.

Exempel på strukturen:

Alpha Helix: Fingernails eller tånaglar kan tas som ett exempel på en alfa-helixstruktur.

Beta-pläterad plåt: Fjäderns struktur liknar strukturen av betongpläterad plåt.

Strukturens egenskaper:

Alfa Helix: I alfa-helixstruktur finns det 3,6 aminosyror per spiralomgång. Alla peptidbindningarna är trans och plana, och N-H-grupperna i peptidbindningarna pekar i samma riktning, vilket är ungefär parallellt med spiralaxeln. C = O-grupperna av alla peptidbindningar pekar i motsatt riktning, och de är parallella med spiralaxelns axel. C = O-gruppen av varje peptidbindning är bunden till N-H-gruppen i peptidbindningen som bildar en vätebindning. Alla R-grupper pekar utåt från spiralen.

Beta-pläterad plåt: Varje peptidbindning i beta-pläterad plåt är plan och har trans-konformation. C = O- och N-H-grupperna av peptidbindningar från intilliggande kedjor ligger i samma plan och pekar mot varandra som bildar vätebindning mellan dem. Alla R-grupperna i vilken kedja som helst kan alternativt förekomma ovanför och under arkets plan.

Definitioner:

Sekundär struktur: Det är formen av ett vikningsprotein på grund av vätebindning mellan dess ryggradamid och karbonylgrupper.

Referenser: "Proteinstruktur". ChemWiki: Den sekundära strukturen för dynamisk kemi Hypertext "α-Helices and P-Sheets". Proteinstructures. com av Salam Al Karadaghi "Organic Chemistry". Virtual Cell Textbook "Beta Sheet". Wikipedia Image Courtesy: "Helix electron density density myoglobin 2nrl 17-32" Av Dcrjsr - Egent arbete (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia "Protein sekundär struktur" av en: Användare: Bikadi (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia "1gwe antipar beta blad båda" av Dcrjsr - eget arbete (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia